Młodzieżowy Dom Kultury jest utrzymywany ze środków organu prowadzącego jako jednostka samorządowa Urzędu Miasta Kalisza. Placówka prowadzi gospodarkę finansową na zasadach jednostki budżetowej rozliczającej się bezpośrednio z budżetem Urzędu Miasta Kalisza.
Prezydent Miasta Kalisza ustanowił zarząd trwały na rzecz MDK do nieruchomości położonej w Kaliszu przy ulicy Teatralnej 3, gdzie mieści się jej siedziba.